Historik raného novověku převzal 26. září 2023 dekret čestné afiliace FF UK, která je platná od 1. srpna 2023 po dobu pěti let. Čestné afiliace FF UK vznikly v roce 2015 za účelem posílení excelence a internacionalizace vědy a výuky na FF UK.
Prof. Martin Holý absolvoval na FF UK magisterské studium historie a archivnictví, kde pokračoval i v doktorském studiu českých dějin. V letech 2011–2017 působil na Ústavu českých dějin FF UK, nejprve jako odborný asistent a později jako docent, kterým byl jmenovaný v roce 2013. Mimo své nynější externí pedagogické působení na Ústavu světových dějin FF UK vyučuje také na FF UJEP a Universität Potsdam a vede řadu doktorandů, studentů magisterského i bakalářského studia.
Podílí se na výuce širokého spektra kurzů – od specializačních přednášek přes výběrové semináře a povinně volitelné předměty až po zapojení do povinných přednášek a seminářů pro všechny stupně studia. Přednáší také v kurzech univerzity třetího věku a zároveň působí jako předseda i člen zkušebních komisí různého druhu.
Prof. Holý se specializuje na kulturní a intelektuální dějiny střední Evropy pozdního 15. až
raného 18. století. Publikoval či spoluvydal devět monografií a desítky studií a kapitol
v domácích i zahraničních publikacích i odborných časopisech. Pravidelně se podílí na řešení domácích i zahraničních výzkumných projektů a účastní se či organizuje sympozia a konference k raně novověkým či časově průřezově pojatým tématům. Je místopředsedou pracovní skupiny Arbeitskreis für vormoderne Erziehungsgeschichte zkoumající předmoderní dějiny vzdělávání, je členem Britsko-česko-slovenského fóra historiků a organizace Comenius Academic Club New York, místopředsedou Wissenschaftliches Wallenstein-Kuratorium či členem českoněmecké komise sbírky pramenů Acta Unitatis Fratrum.
